More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2331 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 122 aa  255  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  70.09 
 
 		 117 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  65.35 
 
 		 116 aa  141  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  47.01 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  40.52 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  38.26 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  39.13 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  39.13 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  39.22 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  36.96 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  36.67 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  36.67 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  36.67 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  36.67 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  33.96 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  30.91 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  34.74 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  31.91 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  32.08 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  33.7 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  33.96 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  31.37 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  35.11 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  32 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  35.11 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  33.71 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  33.7 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  33.7 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  33.7 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  31.13 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  35.96 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  33.7 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  29.35 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>