94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1747 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1009    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  40.98 
 
 
1147 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  46.41 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  42.29 
 
 
646 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  39.01 
 
 
657 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  43.2 
 
 
755 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  41.57 
 
 
491 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  40 
 
 
1668 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  39.11 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  43.78 
 
 
1003 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  43.02 
 
 
700 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  37.99 
 
 
336 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  39.08 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  36.45 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  38.6 
 
 
333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  35.15 
 
 
757 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  35.96 
 
 
1433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  34.83 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  31.69 
 
 
541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  32.96 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  37.93 
 
 
1296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  36.31 
 
 
571 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  35.45 
 
 
1029 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.85 
 
 
1773 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  36.67 
 
 
362 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  36.32 
 
 
477 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  36.09 
 
 
1437 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.02 
 
 
1015 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  35.15 
 
 
558 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  33.95 
 
 
543 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  33.33 
 
 
736 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  47.66 
 
 
308 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  40.62 
 
 
408 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  33.33 
 
 
996 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  31.46 
 
 
688 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.22 
 
 
900 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.84 
 
 
1783 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  31.69 
 
 
1215 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  32.24 
 
 
1055 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  30.68 
 
 
803 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  29.27 
 
 
933 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  32.58 
 
 
1575 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  31.21 
 
 
571 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.45 
 
 
665 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  32.79 
 
 
601 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  29.21 
 
 
634 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  30.43 
 
 
366 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  30.06 
 
 
693 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  26.51 
 
 
1307 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  32.97 
 
 
1294 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.03 
 
 
570 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.8 
 
 
1797 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  25 
 
 
1508 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  28.41 
 
 
675 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  26.17 
 
 
729 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  29.07 
 
 
1174 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  29.83 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  30.1 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  25.86 
 
 
731 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.44 
 
 
1112 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  28.74 
 
 
1263 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.32 
 
 
1318 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  24.79 
 
 
969 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.79 
 
 
971 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  24.79 
 
 
969 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.44 
 
 
1328 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  29.19 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  28.38 
 
 
647 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  25.26 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  31.55 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  30.36 
 
 
725 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  31.54 
 
 
701 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  27.47 
 
 
523 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  26.42 
 
 
745 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  35.09 
 
 
686 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  35.25 
 
 
254 aa  63.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.03 
 
 
687 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 
728 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  25.6 
 
 
846 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  26.82 
 
 
1087 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  33.04 
 
 
221 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0404  hypothetical protein  25.53 
 
 
776 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321562  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  33.04 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  43.33 
 
 
913 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  30.05 
 
 
876 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1954  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.14 
 
 
570 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  31.68 
 
 
827 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2520  NAD+ synthase  25.18 
 
 
306 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2840  hypothetical protein  25.08 
 
 
352 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884921  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.24 
 
 
1575 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_002950  PG0626  hypothetical protein  29.29 
 
 
288 aa  44.3  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2837  hypothetical protein  24.91 
 
 
320 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  36.47 
 
 
981 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00791  Rhs family protein  36.62 
 
 
471 aa  43.5  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0158611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>