15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2840 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2840  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  688    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884921  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2756  hypothetical protein  33.97 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  34.71 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2520  NAD+ synthase  27.33 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  28.67 
 
 		 675 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4374  hypothetical protein  60.53 
 
 		 236 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1134  hypothetical protein  57.14 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0722536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  25.08 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4258  hypothetical protein  27.03 
 
 		 518 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2837  hypothetical protein  27.32 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47785  predicted protein  29.12 
 
 		 477 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1474  hypothetical protein  24.85 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0172447  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2166  hypothetical protein  45.65 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  32.49 
 
 		 693 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1776  hypothetical protein  28.85 
 
 		 548 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.590793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>