83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0384 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1385    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  34.51 
 
 		 571 aa  234  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  34.1 
 
 		 408 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  33.07 
 
 		 394 aa  151  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  43.55 
 
 		 341 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  42.31 
 
 		 646 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  41.99 
 
 		 1003 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  35.03 
 
 		 1668 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  43.02 
 
 		 495 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  40.57 
 
 		 657 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  41.48 
 
 		 491 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1147 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  40.94 
 
 		 1433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  39.16 
 
 		 1437 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  36.56 
 
 		 333 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  36.46 
 
 		 501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6256  hypothetical protein  27.46 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  35.84 
 
 		 336 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  36.26 
 
 		 340 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1029 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  33.14 
 
 		 634 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  41.03 
 
 		 1296 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  34.07 
 
 		 757 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  35.03 
 
 		 371 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  34.81 
 
 		 755 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  36.93 
 
 		 362 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  33.52 
 
 		 324 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  35.29 
 
 		 933 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.36 
 
 		 1773 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  39.5 
 
 		 1174 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  34.88 
 
 		 541 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2648  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1298 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  35.75 
 
 		 571 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  37.04 
 
 		 601 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  32.16 
 
 		 736 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.05 
 
 		 900 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.71 
 
 		 1015 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  25.77 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  31.28 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  32.32 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1055 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  32.72 
 
 		 366 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.53 
 
 		 665 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.91 
 
 		 1783 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  30.39 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.7 
 
 		 1797 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  30.16 
 
 		 996 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  48.31 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  29.89 
 
 		 725 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  33.92 
 
 		 1294 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  26.18 
 
 		 1118 aa  74.7  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1517  hypothetical protein  25.12 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.274829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6319  hypothetical protein  25.32 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.25 
 
 		 1266 aa  70.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  28.79 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.07 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  29.79 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1318 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  31.28 
 
 		 701 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  29.26 
 
 		 1575 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  29.09 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  30.92 
 
 		 647 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  31.25 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.75 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  26.88 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  40.44 
 
 		 866 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  28.98 
 
 		 367 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  27.17 
 
 		 876 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  31.14 
 
 		 1263 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  27.62 
 
 		 803 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.79 
 
 		 570 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  24.85 
 
 		 693 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  25 
 
 		 1215 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  33.75 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  23.28 
 
 		 846 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  25.29 
 
 		 398 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3480  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.79 
 
 		 648 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  26.74 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1570  hypothetical protein  34.33 
 
 		 632 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475185  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  32.14 
 
 		 925 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  35.37 
 
 		 356 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  32.53 
 
 		 1771 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  27.94 
 
 		 230 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>