18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2648 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 1298 aa  2598    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  31.36 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  25.21 
 
 		 1266 aa  70.5  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  36.17 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  30.3 
 
 		 347 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1052 aa  50.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  22.9 
 
 		 1088 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  29.25 
 
 		 772 aa  48.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  24.16 
 
 		 766 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.51 
 
 		 772 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  20.36 
 
 		 1118 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  28.22 
 
 		 779 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  28.22 
 
 		 765 aa  46.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  28.22 
 
 		 755 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  28.22 
 
 		 766 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  28.22 
 
 		 542 aa  45.8  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6256  hypothetical protein  24.69 
 
 		 551 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.61 
 
 		 760 aa  45.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>