More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0919 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1037  serine protease  87.27 
 
 
373 aa  660    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  100 
 
 
377 aa  757    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  85.41 
 
 
377 aa  621  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1036  serine protease  52.71 
 
 
271 aa  253  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000475095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0918  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.54 
 
 
271 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000713648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_906  serine protease, DegP/HtrA family  51.35 
 
 
251 aa  232  9e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000453115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.66 
 
 
389 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  43.12 
 
 
453 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.35 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.46 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39.07 
 
 
395 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  35.25 
 
 
406 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.4 
 
 
513 aa  192  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.98 
 
 
394 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.23 
 
 
569 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  38.86 
 
 
393 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.32 
 
 
386 aa  189  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  37.04 
 
 
389 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  38.32 
 
 
369 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  36.36 
 
 
408 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.14 
 
 
408 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  38.87 
 
 
485 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.02 
 
 
475 aa  186  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.5 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  39.1 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  39.78 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.69 
 
 
366 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  43.33 
 
 
485 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.78 
 
 
479 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  41.85 
 
 
494 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  36.39 
 
 
500 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.13 
 
 
481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.4 
 
 
466 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.26 
 
 
392 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  36.86 
 
 
411 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.92 
 
 
535 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  39.12 
 
 
385 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  39.72 
 
 
382 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.48 
 
 
387 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  37.27 
 
 
459 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  35.2 
 
 
389 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.62 
 
 
381 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  40.15 
 
 
462 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  40.07 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  37.37 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  39.56 
 
 
391 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.28 
 
 
457 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  41.16 
 
 
511 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37.5 
 
 
459 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  39.15 
 
 
492 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.65 
 
 
453 aa  179  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  39.72 
 
 
464 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  34.18 
 
 
474 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  34.44 
 
 
476 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  39.94 
 
 
385 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  42.39 
 
 
476 aa  179  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.13 
 
 
492 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.13 
 
 
477 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.73 
 
 
464 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  36.44 
 
 
508 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.99 
 
 
410 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  42.39 
 
 
490 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.78 
 
 
477 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  39.13 
 
 
423 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  38.69 
 
 
525 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  40.81 
 
 
511 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.11 
 
 
502 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  39.64 
 
 
514 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  35.4 
 
 
361 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  38.19 
 
 
518 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  40.96 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  40.96 
 
 
495 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  40.96 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  40.96 
 
 
495 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  42.91 
 
 
480 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  33.16 
 
 
477 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  40.96 
 
 
495 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  40.96 
 
 
495 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  40.96 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  42.75 
 
 
493 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.35 
 
 
476 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  40.37 
 
 
493 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  40.37 
 
 
494 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  40.37 
 
 
493 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  40.37 
 
 
493 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.66 
 
 
579 aa  175  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  39.42 
 
 
478 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  37.54 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.58 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.88 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.42 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  40.96 
 
 
495 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  39.38 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  41.18 
 
 
487 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  36.64 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  32.58 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.43 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  36.63 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  40.37 
 
 
494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.33 
 
 
474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>