More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1036 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1036  serine protease  100 
 
 
271 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000475095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0918  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  92.99 
 
 
271 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000713648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_906  serine protease, DegP/HtrA family  92.03 
 
 
251 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000453115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  53.33 
 
 
373 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  52.71 
 
 
377 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  58.77 
 
 
377 aa  234  9e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  50 
 
 
393 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  42.07 
 
 
453 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  43.98 
 
 
391 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  47.22 
 
 
385 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  43.05 
 
 
500 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  45.29 
 
 
395 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.19 
 
 
392 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.07 
 
 
415 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  46.08 
 
 
389 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  44.49 
 
 
511 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  40.89 
 
 
411 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  49.13 
 
 
511 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  47.51 
 
 
420 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  42.67 
 
 
424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.95 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  36.04 
 
 
487 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  38.98 
 
 
415 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  47.65 
 
 
464 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  39.62 
 
 
408 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  36.98 
 
 
477 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  36.98 
 
 
479 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  39.62 
 
 
408 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  46.52 
 
 
388 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  40.89 
 
 
402 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  38.22 
 
 
382 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.46 
 
 
387 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.1 
 
 
366 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  36.6 
 
 
477 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  48 
 
 
385 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  41.79 
 
 
308 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  37.94 
 
 
389 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  44.71 
 
 
487 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  39.57 
 
 
444 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  44.71 
 
 
477 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.08 
 
 
428 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  40.55 
 
 
351 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  45.6 
 
 
474 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.53 
 
 
410 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  36.23 
 
 
492 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  42.29 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  43.59 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  43.52 
 
 
411 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  37.17 
 
 
372 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  45.6 
 
 
474 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  46.45 
 
 
425 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.25 
 
 
487 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  45.35 
 
 
511 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  39.23 
 
 
350 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.07 
 
 
569 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  40.29 
 
 
379 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  39 
 
 
401 aa  138  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  42.94 
 
 
488 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  46.24 
 
 
474 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.65 
 
 
399 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.66 
 
 
485 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  43.16 
 
 
459 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  42.22 
 
 
471 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  45.88 
 
 
496 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5254  2-alkenal reductase  39.71 
 
 
395 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  41.48 
 
 
442 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  40.99 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45 
 
 
415 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.3 
 
 
476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.71 
 
 
472 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1346  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.99 
 
 
508 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.21 
 
 
401 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  42.94 
 
 
514 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  40.19 
 
 
368 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  41.14 
 
 
464 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.36 
 
 
476 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  37.75 
 
 
506 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  46.78 
 
 
483 aa  135  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.36 
 
 
396 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  34.98 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  34.98 
 
 
383 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  42.34 
 
 
397 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  49.12 
 
 
409 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.89 
 
 
476 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.98 
 
 
478 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  36.9 
 
 
505 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.45 
 
 
614 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  45.09 
 
 
469 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  34.98 
 
 
384 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.99 
 
 
405 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  42.34 
 
 
383 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  41 
 
 
348 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.33 
 
 
509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.4 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.77 
 
 
483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.11 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  34.6 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  45.35 
 
 
516 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.77 
 
 
483 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.64 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>