94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2736 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  100 
 
 
266 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  64.89 
 
 
273 aa  358  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  58.02 
 
 
262 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  53.94 
 
 
280 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  53.01 
 
 
280 aa  284  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  40.51 
 
 
276 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  35.11 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  31.72 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.41 
 
 
268 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  35.04 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  31.52 
 
 
264 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.76 
 
 
300 aa  115  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  26.24 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
300 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  26.89 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  27.02 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
387 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
286 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  33 
 
 
291 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  28.14 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.39 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
296 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  23.35 
 
 
282 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  24.46 
 
 
293 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  23.35 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
381 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
288 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  24.9 
 
 
294 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.88 
 
 
294 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  28.69 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
287 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  23.32 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  30.86 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  30.13 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  21.29 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.58 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  23.98 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
298 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
294 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
298 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
290 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
289 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
318 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  24 
 
 
301 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  24 
 
 
308 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  24.85 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  30.61 
 
 
358 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  24 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.88 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  25.9 
 
 
298 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  26.1 
 
 
278 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
294 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  24 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  27.71 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
300 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
310 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
299 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
300 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  23.32 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>