226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0835 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  59.91 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  59.47 
 
 		 283 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  58.3 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  54.2 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  54.02 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  50.89 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  50.89 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  49.38 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  52.14 
 
 		 302 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  51.23 
 
 		 310 aa  224  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  48.61 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  50.22 
 
 		 305 aa  214  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  49.12 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  48.21 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  44.25 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  51.74 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  47.53 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  48.48 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  47.77 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  42.39 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.67 
 
 		 279 aa  194  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  45.78 
 
 		 281 aa  192  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  46.02 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  45.09 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  45.71 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  44.65 
 
 		 286 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  41.52 
 
 		 270 aa  171  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  46.26 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  44.14 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  41.33 
 
 		 276 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  39.15 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  36.77 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 295 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 295 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  40.66 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  43.53 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  39.56 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  40.62 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  38.04 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.04 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.02 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.02 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.02 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  37.8 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  38.04 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  38.04 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  38.04 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  37.8 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  37.8 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  37.8 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  34.02 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.59 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  38.64 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  34.02 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  38.64 
 
 		 334 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  32.98 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.8 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  31.91 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.37 
 
 		 352 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  35.63 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  31.91 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  44.26 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>