More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2091 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  738    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  69.38 
 
 
359 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
355 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  51.82 
 
 
355 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.82 
 
 
358 aa  286  4e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 
363 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  45.11 
 
 
356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.45 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.42 
 
 
362 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  44.81 
 
 
364 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.62 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
367 aa  268  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  47.54 
 
 
353 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  46.96 
 
 
358 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  40.54 
 
 
363 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 
368 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  49.43 
 
 
356 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  42.9 
 
 
369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  50.71 
 
 
352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.4 
 
 
361 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.23 
 
 
349 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  52.46 
 
 
353 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  50.71 
 
 
384 aa  265  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.09 
 
 
370 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  46.5 
 
 
353 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  51.9 
 
 
357 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  53.07 
 
 
388 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.52 
 
 
386 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.01 
 
 
367 aa  262  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  45.45 
 
 
352 aa  262  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 
354 aa  262  8e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  39.73 
 
 
363 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  49.8 
 
 
350 aa  262  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.01 
 
 
362 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.79 
 
 
360 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  42.72 
 
 
360 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  42.72 
 
 
360 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  43.15 
 
 
347 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.95 
 
 
355 aa  259  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  50 
 
 
357 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.86 
 
 
369 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  43.85 
 
 
366 aa  258  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  42.36 
 
 
349 aa  258  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  42.27 
 
 
360 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  42.72 
 
 
360 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  42.72 
 
 
360 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.08 
 
 
356 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.34 
 
 
331 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  40.98 
 
 
339 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  51.44 
 
 
383 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  47.42 
 
 
352 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  50 
 
 
357 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.1 
 
 
360 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.69 
 
 
367 aa  257  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3956  ABC transporter related  44.97 
 
 
355 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.396032  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  42.58 
 
 
356 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  43.93 
 
 
359 aa  256  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 
353 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  46.36 
 
 
367 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  48.62 
 
 
356 aa  257  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
353 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  40.76 
 
 
363 aa  256  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41.99 
 
 
355 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  43.4 
 
 
350 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 
359 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.55 
 
 
346 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.99 
 
 
359 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 
363 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  44.52 
 
 
342 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.61 
 
 
366 aa  255  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  42.58 
 
 
356 aa  255  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.02 
 
 
369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  45.71 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  47.08 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  46.13 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  43.53 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  47 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  46.62 
 
 
353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.68 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  44.37 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  48.61 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  53.62 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.76 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  43.94 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  50.81 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.46 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.67 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  48.8 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.07 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  47.77 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  46.05 
 
 
364 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  47.2 
 
 
365 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  46.71 
 
 
352 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  50.41 
 
 
364 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.93 
 
 
363 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  43.13 
 
 
368 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 
331 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  46.23 
 
 
399 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>