More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1279 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 364 aa  743    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  81.66 
 
 		 353 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.86 
 
 		 357 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  74.86 
 
 		 357 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.16 
 
 		 355 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.2 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.64 
 
 		 374 aa  364  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.81 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.93 
 
 		 374 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.62 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.74 
 
 		 371 aa  342  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.58 
 
 		 373 aa  341  9e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.61 
 
 		 375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.93 
 
 		 354 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.27 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.12 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.55 
 
 		 343 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.52 
 
 		 348 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.93 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.9 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.7 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.38 
 
 		 347 aa  322  9.000000000000001e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  47.32 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  51 
 
 		 348 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.84 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 336 aa  316  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.77 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.16 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  48.08 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.08 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  48.08 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.08 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.08 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.78 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  48.08 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  48.08 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.8 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.24 
 
 		 342 aa  305  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.31 
 
 		 355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  48.08 
 
 		 361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  47.79 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  47.55 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.56 
 
 		 362 aa  302  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.85 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.06 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.34 
 
 		 478 aa  299  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.46 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  48.11 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  45.29 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.21 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.32 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  46.32 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.23 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.07 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.95 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.57 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  43.98 
 
 		 359 aa  292  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.05 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  45.59 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  43.95 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  45.18 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.64 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  47.13 
 
 		 361 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  47.13 
 
 		 361 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  47.13 
 
 		 361 aa  289  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  43.25 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  45.65 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  45.26 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  44.78 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  43.64 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.56 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  45.43 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.4 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  44.17 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  45.62 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  45.48 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  46.6 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  44.07 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  44.69 
 
 		 360 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  44.71 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  43.56 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  44.28 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  43.24 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  43.37 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5538  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  44.04 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0770  tartrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5903  tartrate dehydrogenase  44.13 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  46.93 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0014  tartrate dehydrogenase  41.64 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1440  tartrate dehydrogenase  41.64 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5565  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.21 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1159  tartrate dehydrogenase  41.64 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>