More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3769 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3769  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  597  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.283182  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4274  transcriptional regulator, LysR family  74.4 
 
 		 297 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6414  LysR family transcriptional regulator  69.59 
 
 		 296 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.773226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2910  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.91 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.09 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  28.73 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  32.45 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  28.73 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1836  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.67 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  30.48 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.04 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0439  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2319  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0803  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7271  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2354  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4035  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3504  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7162  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 317 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0286  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.794567 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7274  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  26.84 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5369  putative LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1755  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5443  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.83 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  28.41 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>