102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1541 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  261  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  95.42 
 
 
131 aa  247  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  44 
 
 
394 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  53.49 
 
 
369 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  41.07 
 
 
422 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  37.31 
 
 
680 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  51.11 
 
 
380 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  29.7 
 
 
412 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  47.06 
 
 
388 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.27 
 
 
615 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  42 
 
 
410 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.72 
 
 
573 aa  47  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  38.46 
 
 
448 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  50 
 
 
369 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1546  hypothetical protein  41.82 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  42 
 
 
393 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  47.83 
 
 
426 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  44.9 
 
 
460 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  44 
 
 
395 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.17 
 
 
640 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  45.65 
 
 
513 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1549  DNA replication and repair protein RecF  42.22 
 
 
359 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.638976  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  48.84 
 
 
653 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  36.54 
 
 
448 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  51.06 
 
 
419 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  27.88 
 
 
389 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  40.91 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  44.9 
 
 
453 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  44.44 
 
 
382 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  31.08 
 
 
595 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  48.89 
 
 
359 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  42 
 
 
390 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  42 
 
 
390 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  42 
 
 
390 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  42 
 
 
390 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.22 
 
 
626 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  43.14 
 
 
450 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  41.18 
 
 
387 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  42.22 
 
 
390 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  51.11 
 
 
519 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  42.22 
 
 
390 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  42.22 
 
 
390 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  41.18 
 
 
387 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  41.18 
 
 
387 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  45.45 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  44.44 
 
 
378 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  40 
 
 
626 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  41.3 
 
 
347 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  37.04 
 
 
387 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  40.43 
 
 
359 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  35.85 
 
 
385 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  45.24 
 
 
411 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  43.75 
 
 
641 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  47.83 
 
 
670 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  37.04 
 
 
387 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  46.51 
 
 
628 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  41.67 
 
 
395 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0105  SMC domain protein  39.29 
 
 
543 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  41.3 
 
 
378 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  40 
 
 
388 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  33.33 
 
 
681 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  40.43 
 
 
368 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.18 
 
 
639 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  41.82 
 
 
459 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  39.22 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  40 
 
 
457 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  47.62 
 
 
419 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  37.25 
 
 
418 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  46.94 
 
 
424 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.07 
 
 
386 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  47.5 
 
 
580 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  34.62 
 
 
648 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  41.82 
 
 
478 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  48.94 
 
 
1181 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  44.68 
 
 
368 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  42.22 
 
 
378 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  45.83 
 
 
437 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  39.13 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  37.78 
 
 
388 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  30.86 
 
 
388 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  35.56 
 
 
529 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  41.18 
 
 
416 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  52.5 
 
 
812 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  35.48 
 
 
571 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  51.16 
 
 
614 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  38 
 
 
603 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  48.57 
 
 
378 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.89 
 
 
663 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  37.25 
 
 
386 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  32.65 
 
 
409 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  40 
 
 
603 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  42.22 
 
 
379 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  38.1 
 
 
382 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  38.1 
 
 
382 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  35.71 
 
 
514 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  33.33 
 
 
591 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>