More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0997 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 579 aa  1167    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  43.71 
 
 		 563 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  43.73 
 
 		 563 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  42.69 
 
 		 545 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  40.98 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  42.75 
 
 		 600 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  42.09 
 
 		 563 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  42.09 
 
 		 563 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  41.34 
 
 		 566 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  38.73 
 
 		 572 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 545 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  37.73 
 
 		 545 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  38 
 
 		 550 aa  333  7.000000000000001e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  38.45 
 
 		 593 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 546 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 		 556 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  43.19 
 
 		 520 aa  292  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 524 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 549 aa  276  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 559 aa  253  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  40.06 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  35.03 
 
 		 538 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  34.27 
 
 		 581 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 545 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 542 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 545 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 545 aa  177  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 230 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 345 aa  97.4  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 395 aa  97.1  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 358 aa  97.1  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 356 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 685 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 1127 aa  77.4  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 297 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.88 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  27.33 
 
 		 1128 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  33.53 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  22.09 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1118 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1118 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1118 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1120 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1120 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 310 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.82 
 
 		 1144 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 860 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  26.97 
 
 		 1115 aa  72.8  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  25.98 
 
 		 1133 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  27.33 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  27.33 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  27.33 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  27.53 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1118 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  27.53 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  26.26 
 
 		 1130 aa  70.1  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 794 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  24.42 
 
 		 277 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 270 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  29.35 
 
 		 449 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 305 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 267 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  26.97 
 
 		 264 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 		 273 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  23.86 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  24.52 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  23.08 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  30.46 
 
 		 803 aa  67.8  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25.79 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 299 aa  67  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 295 aa  67  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 296 aa  67  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 1110 aa  67  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  27.07 
 
 		 1067 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 276 aa  67  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 1067 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  25.45 
 
 		 825 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>