More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0260 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 707 aa  1425    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 760 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  36.44 
 
 		 486 aa  129  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  30.29 
 
 		 644 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  34.17 
 
 		 522 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.18 
 
 		 845 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  29.93 
 
 		 671 aa  98.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  29.41 
 
 		 481 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  32.69 
 
 		 413 aa  87  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3140  putative serine protease protein  32.04 
 
 		 305 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  30.41 
 
 		 772 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  29.02 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.95 
 
 		 383 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  35.29 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  32.62 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  27.75 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  35.33 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  31.18 
 
 		 453 aa  77  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  25.9 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  32.42 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  31.84 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3072  putative serine protease protein  31.43 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  31.25 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  28.4 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3418  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.43 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  33.51 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  33.51 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  31.28 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  32.81 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1036  serine protease  33.33 
 
 		 271 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000475095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  27.37 
 
 		 330 aa  73.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2185  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.41 
 
 		 384 aa  73.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  31.21 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  30.07 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  35.17 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  27.53 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  31.67 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0918  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.14 
 
 		 271 aa  72  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000713648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.64 
 
 		 394 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  34.93 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  32.8 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  30.52 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  35.53 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_906  serine protease, DegP/HtrA family  31.87 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000453115  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  32.74 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  32.74 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  32.42 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  33.53 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  30.06 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  34.24 
 
 		 473 aa  70.5  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  32.24 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  32.76 
 
 		 476 aa  70.5  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  35.37 
 
 		 389 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  32.78 
 
 		 510 aa  70.5  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1343  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.98 
 
 		 536 aa  69.7  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.937553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  36.05 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  31.82 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  31.33 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  31.07 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  29.38 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  30.46 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  31.49 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1392  protease Do  30.29 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  26.58 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  33.73 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  26.59 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  31.33 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  30.99 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  31.87 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0500  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.81 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  29.89 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  35.47 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.81 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  29.65 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  28.57 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  33.33 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  31.98 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  31.69 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  24.43 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  30.94 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1585  hypothetical protein  27.67 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  28.95 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  29.83 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.86 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  33.15 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  32.24 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  33.82 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  31.18 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  33.11 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.95 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  32.35 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  32.35 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  28.65 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  29.35 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  30.99 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  29.86 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  31.69 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  33.57 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>