225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0774 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  62.47 
 
 
758 aa  944    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  100 
 
 
904 aa  1875    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  67.52 
 
 
914 aa  1223    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  35.02 
 
 
925 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  34.17 
 
 
922 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  35.42 
 
 
916 aa  369  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  34.22 
 
 
932 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  34.81 
 
 
928 aa  347  5e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.21 
 
 
905 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  24.88 
 
 
905 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.09 
 
 
907 aa  105  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.09 
 
 
900 aa  105  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.74 
 
 
905 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.74 
 
 
905 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.22 
 
 
905 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.91 
 
 
1203 aa  101  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.26 
 
 
906 aa  98.2  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  22.92 
 
 
1121 aa  91.7  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  32.04 
 
 
1523 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  29.47 
 
 
903 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  30.18 
 
 
934 aa  86.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  33.2 
 
 
901 aa  85.9  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  26.94 
 
 
908 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.12 
 
 
986 aa  83.2  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  29.62 
 
 
1557 aa  82.8  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.15 
 
 
946 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24 
 
 
1002 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.62 
 
 
902 aa  78.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  26.03 
 
 
958 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  23.6 
 
 
1041 aa  77.4  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.35 
 
 
1363 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.15 
 
 
629 aa  77  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 
975 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  29.31 
 
 
650 aa  75.5  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  28.28 
 
 
650 aa  75.5  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  31.35 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  40.91 
 
 
1950 aa  74.3  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.88 
 
 
1428 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.52 
 
 
619 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  40.91 
 
 
1958 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.82 
 
 
1575 aa  73.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.12 
 
 
622 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.43 
 
 
655 aa  73.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  30.12 
 
 
622 aa  72.4  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.15 
 
 
902 aa  72.4  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  39.81 
 
 
1959 aa  72  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.9 
 
 
1196 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  34.33 
 
 
2013 aa  70.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  42.86 
 
 
2125 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  42.86 
 
 
2125 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  28.28 
 
 
1474 aa  70.1  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  25.53 
 
 
1062 aa  68.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  43.33 
 
 
1958 aa  68.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.6 
 
 
752 aa  68.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  26.58 
 
 
1408 aa  68.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.22 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  32.14 
 
 
2016 aa  68.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  29.01 
 
 
1724 aa  68.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  33.87 
 
 
1888 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  27.24 
 
 
769 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  42.05 
 
 
2002 aa  67.4  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  34.92 
 
 
2222 aa  67.4  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  35.82 
 
 
2096 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  28.15 
 
 
1629 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  28.86 
 
 
1296 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  27.32 
 
 
1410 aa  67  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  33.05 
 
 
1722 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  37.89 
 
 
1983 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  22.62 
 
 
1620 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  37.89 
 
 
1986 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  28.92 
 
 
1118 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  34.65 
 
 
1593 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  30 
 
 
1185 aa  66.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  39.13 
 
 
1803 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.6 
 
 
1116 aa  64.7  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.77 
 
 
1126 aa  64.7  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  38.04 
 
 
2207 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  27.46 
 
 
1630 aa  64.3  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  43.24 
 
 
2045 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.49 
 
 
759 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.78 
 
 
952 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  39.77 
 
 
1838 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  37.5 
 
 
1853 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  25.16 
 
 
1861 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  39.51 
 
 
1572 aa  63.9  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  29.15 
 
 
1090 aa  63.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  38.21 
 
 
2098 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  38.1 
 
 
2005 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.21 
 
 
1099 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.94 
 
 
611 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  36.08 
 
 
1991 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.57 
 
 
633 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  23.44 
 
 
1132 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  25.58 
 
 
1335 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  44.44 
 
 
1980 aa  62  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  37.65 
 
 
2204 aa  62  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  36.36 
 
 
1575 aa  62  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.38 
 
 
464 aa  62  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 
2101 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 
2101 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>