140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3332 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  41.72 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  35.56 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  32.24 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.21 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  39.19 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  32.54 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  28.89 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  32 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  22.39 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  22.39 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  22.39 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  22.39 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  22.39 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  22.39 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  29.73 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  29.73 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  29.73 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  23.42 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  29.13 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  25.93 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  27.72 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  26.73 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  25.93 
 
 		 164 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  28.3 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  23.73 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>