220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1196 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 639 aa  1314    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  54.15 
 
 		 613 aa  614  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  53.8 
 
 		 625 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  58.94 
 
 		 536 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  56.01 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  47.54 
 
 		 792 aa  482  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  50 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  51.17 
 
 		 551 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  46.44 
 
 		 563 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  49.69 
 
 		 706 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  48.42 
 
 		 651 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  49.9 
 
 		 698 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  48 
 
 		 651 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  45.17 
 
 		 633 aa  438  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  50 
 
 		 642 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  50 
 
 		 642 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  50 
 
 		 627 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  47.42 
 
 		 621 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  46.49 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  47.88 
 
 		 592 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  47.5 
 
 		 625 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  47.34 
 
 		 612 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  49.59 
 
 		 642 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  42.16 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  51.21 
 
 		 640 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  50.95 
 
 		 708 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  47.5 
 
 		 624 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  47.5 
 
 		 613 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  45.16 
 
 		 598 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  45.25 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.38 
 
 		 588 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  45.97 
 
 		 575 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  46.4 
 
 		 686 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.97 
 
 		 575 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  47.23 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  43.4 
 
 		 629 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  43.34 
 
 		 555 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  44.9 
 
 		 654 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  52.82 
 
 		 350 aa  334  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  34.66 
 
 		 610 aa  286  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  34 
 
 		 490 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  38.18 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  34.12 
 
 		 859 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 		 935 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.44 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.14 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 		 462 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.71 
 
 		 472 aa  100  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  32.66 
 
 		 412 aa  97.4  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 411 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.71 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 425 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  30.15 
 
 		 425 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.93 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.39 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  32.02 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 		 430 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 		 418 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.12 
 
 		 412 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 		 808 aa  67.4  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  40.7 
 
 		 92 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1107 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 		 419 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  26.2 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  30.59 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  22.66 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  25.62 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 780 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.5 
 
 		 653 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 1050 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1021 aa  55.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 		 592 aa  54.7  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 955 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  25.95 
 
 		 452 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 958 aa  53.9  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.74 
 
 		 673 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  24.54 
 
 		 701 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  29.58 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  30.58 
 
 		 971 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 1094 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 924 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  24.11 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  24.45 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>