83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0131 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  100 
 
 		 258 aa  537  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  74.8 
 
 		 254 aa  400  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  72.37 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  72.05 
 
 		 251 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  60.38 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0147  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  88.28 
 
 		 128 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.138783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2080  hypothetical protein  44.95 
 
 		 193 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365514  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0327  hypothetical protein  44.22 
 
 		 205 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00781136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0670  hypothetical protein  45.32 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000833206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2372  hypothetical protein  41.33 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1335  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  42.29 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1181  hypothetical protein  60.78 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3165  hypothetical protein  63.92 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0219  hypothetical protein  63.04 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0202  hypothetical protein  60.82 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000154099 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  48.57 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2011  hypothetical protein  30.57 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.515904  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  43.48 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  62.16 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  35.42 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  57.5 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  61.11 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  48 
 
 		 730 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  38.98 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  36.71 
 
 		 739 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  58.33 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  58.33 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  51.28 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  57.14 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  60.53 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  57.89 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  39.62 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  48.57 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  36.9 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  46.15 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  44.44 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  47.37 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  58.82 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  55.56 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  37.93 
 
 		 841 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  58.33 
 
 		 744 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  37.5 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  47.5 
 
 		 671 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  47.22 
 
 		 696 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  50 
 
 		 671 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  33.8 
 
 		 765 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  46.51 
 
 		 708 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  47.5 
 
 		 670 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 671 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  47.5 
 
 		 670 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  43.14 
 
 		 669 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  39.68 
 
 		 680 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  45.24 
 
 		 670 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  54.29 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 670 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  37.21 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  51.52 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 676 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 676 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  50 
 
 		 670 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  48.65 
 
 		 760 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 655 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  48.48 
 
 		 779 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  31.94 
 
 		 894 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  48.48 
 
 		 779 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  46.88 
 
 		 684 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  56 
 
 		 679 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  42.5 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  30.21 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  32.08 
 
 		 689 aa  42.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 751 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  47.22 
 
 		 666 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08201  DNA topoisomerase III  32.88 
 
 		 734 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  45.45 
 
 		 836 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  35.09 
 
 		 798 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  48.48 
 
 		 859 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  39.47 
 
 		 694 aa  42.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  32.2 
 
 		 756 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  45.24 
 
 		 931 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  54.29 
 
 		 935 aa  42  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  43.24 
 
 		 747 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>