110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0460 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 338 aa  689    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  54.22 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  50.15 
 
 		 336 aa  315  9e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  42.99 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  41.12 
 
 		 341 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  40.84 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  36.47 
 
 		 344 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  36.94 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  35.76 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  35.93 
 
 		 335 aa  199  7e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  26.28 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.39 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.4 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.32 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.4 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.39 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.48 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  22.53 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.91 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.77 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  26.22 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  26.52 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  26.52 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  23.39 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  26.16 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  27.43 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.81 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.13 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  23.04 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  27.5 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  21.12 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  20.8 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.33 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  19.68 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  19.68 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  20.75 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  20.3 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  26.56 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.57 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  28.66 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  19.69 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  21.17 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  18.41 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  23.96 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  23.96 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.12 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.76 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  19.06 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  18.75 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.29 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf317  DNA polymerase III, delta subunit  25.64 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  20.68 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  20.29 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  19.55 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  24.14 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  15.81 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01661  putative DNA polymerase III, delta subunit, probably ATP hydrolase  24.4 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000516884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2130  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0903224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  18.71 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  20.38 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  19.05 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  22.18 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  22.18 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  21.66 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  22.28 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.38 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  21.15 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  21.22 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  19.17 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  17.73 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  20.25 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  29.55 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2928  DNA polymerase III subunit delta  21.43 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1844  DNA polymerase III subunit delta  21.43 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3017  DNA polymerase III subunit delta  21.43 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336067  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>