79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0227 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0227  bacterio-opsin activator  100 
 
 
229 aa  470  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0551  bacterio-opsin activator  35.24 
 
 
254 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.199314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0779  bacterio-opsin activator  42.67 
 
 
239 aa  169  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0917  bacterio-opsin activator  35.59 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1423  bacterio-opsin activator  37.1 
 
 
236 aa  142  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.487577  normal  0.0402926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  33.33 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0840  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.04 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1803  bacterio-opsin activator  27.44 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000152108  normal  0.762751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  34.91 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.34 
 
 
252 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  29.03 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2585  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.93 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0287  bacterio-opsin activator  31.65 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0100333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.77 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  37.38 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1820  bacterio-opsin activator  51.02 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825916  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5265  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.777713  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  49.06 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0407  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.32 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.09 
 
 
204 aa  52  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.34 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.58 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 
553 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30 
 
 
226 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  24.3 
 
 
203 aa  48.5  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.86 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  41.07 
 
 
982 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3238  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.1 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.68 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3197  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.69 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.16 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.3 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 
449 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.91 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.84 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1249  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.93 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.48 
 
 
728 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4235  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.5 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 
532 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.62 
 
 
336 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0295  bacterio-opsin activator  43.4 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
896 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.43 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  24.22 
 
 
750 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1952  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.88 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.46 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 
1081 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  35.38 
 
 
192 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.45 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 
1969 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.58 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 
644 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  26.96 
 
 
537 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
991 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  24.53 
 
 
1589 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  26.42 
 
 
994 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.71 
 
 
245 aa  42.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3471  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.54 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0856  HTH DNA binding domain-containing protein  34.62 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.08 
 
 
228 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 
770 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  23.76 
 
 
666 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.05 
 
 
254 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 
781 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3371  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.98 
 
 
238 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0431934  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
539 aa  41.6  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0534  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 
379 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.03 
 
 
216 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  23.42 
 
 
243 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>