More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2410 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 163 aa  315  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  54.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  52.78 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 		 159 aa  124  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  52.35 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  45.64 
 
 		 184 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  40.16 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  37.33 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  34.56 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  42.2 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  30.83 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40.38 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  47.83 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  47.83 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  34.86 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  33.05 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  32.2 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30.53 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  43.3 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  36.45 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  43.48 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 183 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  34.71 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  45.21 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  29.91 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>