68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1972 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 501 aa  1029    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  55.46 
 
 		 571 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  42.51 
 
 		 325 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  38.73 
 
 		 493 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  33.62 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.91 
 
 		 494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  34.71 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  31.72 
 
 		 1197 aa  158  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  37.15 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1278 aa  146  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  30.39 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  30.8 
 
 		 360 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  30.85 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30.15 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  25.78 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  34.02 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  26.52 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  28 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  30.41 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  31.67 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  30.8 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.87 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  29.02 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  26.62 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  29.41 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.87 
 
 		 538 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  25.71 
 
 		 317 aa  54.3  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  29.33 
 
 		 468 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  30.73 
 
 		 746 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.05 
 
 		 547 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.64 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.8 
 
 		 337 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  27.7 
 
 		 1186 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  26.92 
 
 		 541 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  23.81 
 
 		 383 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.71 
 
 		 546 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  25.89 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  26.5 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  20.91 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 855 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  27.81 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 348 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 		 636 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.95 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  25.35 
 
 		 550 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  27.27 
 
 		 553 aa  47.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  23.42 
 
 		 540 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  25.54 
 
 		 679 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  23.68 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.7 
 
 		 316 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 699 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  25.52 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 1195 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 		 323 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  26.94 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.12 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  20.56 
 
 		 504 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.92 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  22.3 
 
 		 522 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.4 
 
 		 537 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  22.43 
 
 		 1338 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  23.81 
 
 		 535 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  25.47 
 
 		 552 aa  43.5  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>