83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3807 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  50 
 
 		 689 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  50.44 
 
 		 674 aa  653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1410    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.94 
 
 		 669 aa  330  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.25 
 
 		 677 aa  280  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.25 
 
 		 677 aa  280  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  30.22 
 
 		 696 aa  278  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  33.09 
 
 		 780 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.14 
 
 		 793 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  27.28 
 
 		 728 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  31.35 
 
 		 744 aa  255  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  32.1 
 
 		 782 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  27.05 
 
 		 707 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30.83 
 
 		 762 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30.97 
 
 		 773 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  28.53 
 
 		 714 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  29.66 
 
 		 784 aa  230  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  32.4 
 
 		 807 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  26.42 
 
 		 748 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  33.16 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  29.91 
 
 		 763 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  26.52 
 
 		 769 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  22.1 
 
 		 773 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  37.95 
 
 		 553 aa  95.1  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  27.57 
 
 		 594 aa  91.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  25.64 
 
 		 594 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  28.38 
 
 		 623 aa  90.5  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  27.44 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  29.57 
 
 		 695 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.3 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  30.19 
 
 		 613 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  22.63 
 
 		 712 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  32.14 
 
 		 758 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  27.62 
 
 		 596 aa  72.4  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.93 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  21.88 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  23.61 
 
 		 569 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  23.61 
 
 		 569 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  30.81 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.73 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.91 
 
 		 703 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  23.11 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  24.86 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  21.74 
 
 		 565 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.96 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  22 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.23 
 
 		 594 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.87 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.42 
 
 		 669 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  30.1 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  26.7 
 
 		 661 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.57 
 
 		 603 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.47 
 
 		 589 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  29.05 
 
 		 645 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  25.38 
 
 		 566 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.68 
 
 		 584 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  26.13 
 
 		 642 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.7 
 
 		 573 aa  52.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.29 
 
 		 578 aa  51.6  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  25.48 
 
 		 585 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  23.41 
 
 		 478 aa  51.2  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  29.13 
 
 		 680 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.83 
 
 		 669 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  20.57 
 
 		 520 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  27.07 
 
 		 522 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  22.71 
 
 		 603 aa  48.9  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  22.41 
 
 		 564 aa  48.9  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.98 
 
 		 548 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.6 
 
 		 582 aa  47.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.48 
 
 		 685 aa  47.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 574 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.65 
 
 		 437 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 533 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 639 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.53 
 
 		 566 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  25.7 
 
 		 537 aa  46.6  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  25.12 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.6 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  48 
 
 		 647 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  32.43 
 
 		 454 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  24.73 
 
 		 634 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  51.28 
 
 		 440 aa  44.3  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.77 
 
 		 608 aa  43.9  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>