More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2779 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  100 
 
 		 445 aa  903    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  51.13 
 
 		 444 aa  358  7e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  38.7 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  37.6 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  37.6 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  36.86 
 
 		 447 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  37.5 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  35.15 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  32.69 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  31.98 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  32.65 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  32.45 
 
 		 359 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  30.88 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  35.09 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  31.1 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  34.44 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.08 
 
 		 513 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  27.02 
 
 		 485 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.07 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.52 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.28 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.21 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  28.27 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.44 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.91 
 
 		 529 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.36 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.44 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.44 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.38 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.02 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.44 
 
 		 485 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.44 
 
 		 485 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.64 
 
 		 517 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.61 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  24.52 
 
 		 591 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.27 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.99 
 
 		 513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.24 
 
 		 803 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.55 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.7 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  29.53 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  26.13 
 
 		 603 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.54 
 
 		 544 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.7 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.19 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.62 
 
 		 446 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.31 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28 
 
 		 595 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.99 
 
 		 453 aa  103  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.85 
 
 		 505 aa  103  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.18 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  28.84 
 
 		 530 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.48 
 
 		 588 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  28.15 
 
 		 533 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  28.15 
 
 		 533 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  28 
 
 		 533 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  28.23 
 
 		 1032 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  32.63 
 
 		 519 aa  99.8  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  29.1 
 
 		 533 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.17 
 
 		 635 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.97 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  26.58 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  31.15 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  28.22 
 
 		 544 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.14 
 
 		 578 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  26.49 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  20.67 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.52 
 
 		 446 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  29.45 
 
 		 463 aa  97.1  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  28.44 
 
 		 531 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.11 
 
 		 484 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.17 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  33.48 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.17 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.51 
 
 		 822 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.22 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.32 
 
 		 497 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  25.28 
 
 		 523 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  23.94 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  27.14 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  31.79 
 
 		 519 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.1 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.15 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  24.11 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  29.66 
 
 		 531 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  28.61 
 
 		 5698 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  24.7 
 
 		 365 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.19 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  27.11 
 
 		 547 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  32.2 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.25 
 
 		 601 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  29.07 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.94 
 
 		 377 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  28.39 
 
 		 536 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  26.49 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  23.39 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.69 
 
 		 543 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.69 
 
 		 543 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>