More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1675 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 608 aa  1184    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  49.35 
 
 		 621 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  49.35 
 
 		 621 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  35.52 
 
 		 641 aa  276  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  49.12 
 
 		 520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  45.7 
 
 		 503 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  43.17 
 
 		 502 aa  253  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  43.28 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  43.34 
 
 		 587 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.84 
 
 		 586 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  37.17 
 
 		 504 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  39.82 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  39.52 
 
 		 501 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2731  secretion protein HlyD family protein  44 
 
 		 497 aa  181  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  35.02 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  24.72 
 
 		 631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 448 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  30.07 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  34.52 
 
 		 477 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 400 aa  111  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.74 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  27.45 
 
 		 533 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  31.01 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  27.19 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.78 
 
 		 481 aa  107  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 541 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 634 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  31.78 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.9 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.31 
 
 		 663 aa  102  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  37.07 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 324 aa  101  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 		 609 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.05 
 
 		 428 aa  98.2  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  24.92 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  23.56 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  30.1 
 
 		 430 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.92 
 
 		 329 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 		 390 aa  93.6  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  32.34 
 
 		 405 aa  93.6  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  30.29 
 
 		 424 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 448 aa  93.6  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0535  hypothetical protein  42.55 
 
 		 222 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  31.68 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 430 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 		 322 aa  91.3  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  29.23 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  30.59 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.43 
 
 		 420 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 335 aa  88.6  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 335 aa  88.6  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.29 
 
 		 517 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  31.53 
 
 		 446 aa  88.2  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 471 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.62 
 
 		 403 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 407 aa  87.8  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.98 
 
 		 430 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  31.8 
 
 		 429 aa  87.4  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 		 402 aa  87  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 516 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  30.93 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4231  hypothetical protein  28.29 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.72 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  34.67 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  29 
 
 		 449 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 428 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.17 
 
 		 521 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  26.05 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  29.53 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  30.09 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.54 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  36.14 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  35.89 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  32.47 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.84 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  30.5 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  33.5 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.64 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  29.02 
 
 		 360 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  30.84 
 
 		 598 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 376 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>