More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1945 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 322 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.22 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  68.61 
 
 		 311 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  61.88 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  65.37 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.34 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  49.36 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 409 aa  105  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  25.86 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  25.38 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 419 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  25.44 
 
 		 357 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  26.09 
 
 		 392 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  28.42 
 
 		 394 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  24.79 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  33.77 
 
 		 621 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  24.93 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 428 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 		 521 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 621 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 		 608 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  29.62 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  36.42 
 
 		 489 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.56 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 		 429 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  32 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  22.62 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  29.61 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  31.94 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 384 aa  82.4  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  39.26 
 
 		 493 aa  82.4  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.54 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  31.66 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2284  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.489118  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  31.6 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  30.35 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.82 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 549 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  27.37 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  28.86 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  31.58 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  26.79 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  25.57 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  29 
 
 		 607 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 		 663 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  34.11 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  31.02 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 446 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  23.97 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  34.62 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  23.93 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.61 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.59 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  33.09 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  22.19 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1576  hypothetical protein  24.36 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000469738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.84 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.29 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  23.7 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  32.38 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.56 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  22.59 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  27.37 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.44 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  27.37 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  27.37 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  23.73 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.92 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>