249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8819 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  41.1 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 165 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  34.86 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 128 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  32.46 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.41 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  32.18 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  29.73 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  27.73 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  27.73 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 154 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 159 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 151 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  29.55 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 140 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 162 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 158 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 137 aa  48.9  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  28.19 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  32.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>