More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8314 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 576 aa  1169    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  43.71 
 
 		 578 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  38.19 
 
 		 570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  39.06 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  37.74 
 
 		 566 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  33.96 
 
 		 568 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 555 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 555 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 		 554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  35.45 
 
 		 591 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  36.19 
 
 		 567 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 		 558 aa  299  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 550 aa  296  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  30.07 
 
 		 565 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.24 
 
 		 579 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 581 aa  234  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  31.26 
 
 		 551 aa  233  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  29.86 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.47 
 
 		 586 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 		 590 aa  191  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 569 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 580 aa  169  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 563 aa  164  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 592 aa  130  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.71 
 
 		 585 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.66 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 567 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.08 
 
 		 581 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 617 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.9 
 
 		 556 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.37 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  23.29 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.72 
 
 		 545 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 538 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  24.31 
 
 		 566 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 559 aa  103  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 575 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.33 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 599 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.4 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  22.79 
 
 		 606 aa  101  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  24.1 
 
 		 619 aa  99.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 604 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 608 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.6 
 
 		 575 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.7 
 
 		 568 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 551 aa  97.8  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 639 aa  97.8  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.18 
 
 		 575 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  23.45 
 
 		 600 aa  97.1  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  24.18 
 
 		 575 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 509 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 624 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  30.13 
 
 		 635 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.36 
 
 		 555 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 534 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 522 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 605 aa  94  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.86 
 
 		 538 aa  94  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 575 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.43 
 
 		 516 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 533 aa  91.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 622 aa  91.3  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.93 
 
 		 524 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.46 
 
 		 559 aa  90.9  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  21.72 
 
 		 557 aa  90.5  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4102  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.99 
 
 		 548 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1267  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.83 
 
 		 548 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 631 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 565 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 581 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 564 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 528 aa  87.8  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 553 aa  87  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.28 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 		 576 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  22.55 
 
 		 622 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 586 aa  86.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.65 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.84 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1107  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.99 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126843  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  23.41 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1095  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 548 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.152355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.4 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1197  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.03 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0197215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  23.62 
 
 		 600 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>