159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6279 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  35.34 
 
 		 248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  33.2 
 
 		 256 aa  98.6  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  32.44 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  32.64 
 
 		 266 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 281 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 343 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 267 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  36.63 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  29.66 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  25.74 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  41.13 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  31.21 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  40.14 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  37.09 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  31.72 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  33.02 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>