More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2356 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 674 aa  1350    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  41.55 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  40.84 
 
 		 584 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  38.89 
 
 		 714 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  40.58 
 
 		 607 aa  389  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  38.96 
 
 		 670 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  40.81 
 
 		 640 aa  369  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  39.33 
 
 		 661 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  38.46 
 
 		 684 aa  357  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  49.86 
 
 		 606 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  43.49 
 
 		 585 aa  336  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  40.65 
 
 		 620 aa  329  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  38.1 
 
 		 653 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  48.34 
 
 		 605 aa  324  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  41.74 
 
 		 585 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  37.5 
 
 		 666 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  45.56 
 
 		 635 aa  313  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  50 
 
 		 680 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  37.36 
 
 		 632 aa  307  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  48.24 
 
 		 566 aa  297  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  47.33 
 
 		 603 aa  293  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  43.8 
 
 		 547 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  48.24 
 
 		 620 aa  289  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  45 
 
 		 656 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  46.62 
 
 		 550 aa  261  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  47.32 
 
 		 617 aa  250  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  48.32 
 
 		 599 aa  248  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  47.3 
 
 		 538 aa  243  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  48.23 
 
 		 649 aa  240  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  44.44 
 
 		 573 aa  225  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  41.04 
 
 		 496 aa  216  9e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.19 
 
 		 977 aa  174  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.13 
 
 		 989 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  39.34 
 
 		 855 aa  169  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  38.08 
 
 		 533 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  37.05 
 
 		 403 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  36.39 
 
 		 534 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 		 532 aa  166  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  36.3 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  36.47 
 
 		 900 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  36.11 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  38.19 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.59 
 
 		 530 aa  160  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  37.04 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  34.19 
 
 		 461 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 		 470 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 		 470 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  34.01 
 
 		 406 aa  157  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.71 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.13 
 
 		 856 aa  156  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 474 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.36 
 
 		 849 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 		 410 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  33.45 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  33.45 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.69 
 
 		 530 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  34.84 
 
 		 471 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  35.94 
 
 		 535 aa  152  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.22 
 
 		 533 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  35.43 
 
 		 533 aa  150  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.79 
 
 		 853 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  35.11 
 
 		 470 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  36.84 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  36.04 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.14 
 
 		 848 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  29.61 
 
 		 489 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  33.99 
 
 		 416 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.34 
 
 		 532 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  31.65 
 
 		 495 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.44 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.54 
 
 		 531 aa  147  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  33.85 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.29 
 
 		 995 aa  146  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  32.67 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.11 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  35.22 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  34.33 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  33.9 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  31.06 
 
 		 487 aa  145  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.81 
 
 		 856 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  35.57 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  33.2 
 
 		 535 aa  144  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  32 
 
 		 487 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.74 
 
 		 839 aa  143  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  32.4 
 
 		 495 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  35.27 
 
 		 533 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  31.03 
 
 		 493 aa  142  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  32.5 
 
 		 413 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  30.12 
 
 		 496 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  28.57 
 
 		 496 aa  141  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 594 aa  140  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  31.76 
 
 		 525 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  29.46 
 
 		 619 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.84 
 
 		 759 aa  140  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  33.45 
 
 		 532 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  33.45 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  32.16 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  34.88 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  32.09 
 
 		 1029 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>