141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2289 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  100 
 
 
414 aa  847    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
441 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  28.93 
 
 
367 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  29.86 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  31.61 
 
 
378 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
388 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
400 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  28.68 
 
 
410 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  28.61 
 
 
393 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  28.36 
 
 
390 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
397 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
378 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  27.68 
 
 
437 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
426 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
426 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.06 
 
 
391 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  28.84 
 
 
402 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
433 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
398 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  28.94 
 
 
402 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
437 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  29.7 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  27.9 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.93 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  27.9 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
428 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  27.22 
 
 
421 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  28.7 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
429 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
391 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
401 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
362 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  26.65 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  26.65 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  26.65 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
387 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
432 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
432 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
432 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  24.61 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
374 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  24.61 
 
 
434 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  24.61 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
418 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  25.15 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  25.22 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  22.82 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
413 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  23.01 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.25 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  22.85 
 
 
409 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  22.67 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  22.15 
 
 
394 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  22.85 
 
 
409 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  22.85 
 
 
409 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
409 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
336 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  23.44 
 
 
336 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  23.44 
 
 
336 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  28.91 
 
 
358 aa  60.1  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  28.27 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
361 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  24.45 
 
 
361 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
326 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  26.3 
 
 
297 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  23.03 
 
 
380 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.22 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>