More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0052 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  100 
 
 		 492 aa  970    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  54.4 
 
 		 387 aa  339  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  53.87 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  52.84 
 
 		 389 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  52.62 
 
 		 372 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.04 
 
 		 395 aa  312  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  50.29 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  52.89 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  53.26 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.86 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  52.45 
 
 		 388 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  52.45 
 
 		 388 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  51.63 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  51.62 
 
 		 415 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  53.72 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  52.55 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  52.76 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  51.2 
 
 		 352 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  50.41 
 
 		 398 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  56.11 
 
 		 514 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  55.66 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  53.8 
 
 		 401 aa  274  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  50.39 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  47.89 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  53.01 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  54.62 
 
 		 379 aa  270  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  54.24 
 
 		 405 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  52.79 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  44.36 
 
 		 432 aa  261  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  44.39 
 
 		 419 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  43.75 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  39.79 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  41.31 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  41.31 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  41.31 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  41.03 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  41.31 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  41.03 
 
 		 455 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  40.11 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  39.66 
 
 		 453 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.04 
 
 		 396 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  36.65 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  40.95 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  37.23 
 
 		 464 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  50.44 
 
 		 412 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  39.1 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  39.44 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  39.52 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  43.71 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  42.07 
 
 		 441 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  38.68 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  42.63 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  41.04 
 
 		 569 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  40.29 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 463 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  40.41 
 
 		 491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  39.16 
 
 		 572 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  36.61 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  43.27 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  39.69 
 
 		 589 aa  243  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  37.25 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  41.38 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  37.43 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  45.48 
 
 		 450 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  41.88 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 474 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  39.67 
 
 		 479 aa  239  8e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  36.39 
 
 		 451 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  42 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  42 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  42 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  42 
 
 		 521 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  42 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  42 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  42 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  41.79 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  44.26 
 
 		 452 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  42.09 
 
 		 450 aa  237  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  39.56 
 
 		 467 aa  237  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  41.56 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  39.47 
 
 		 624 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  42.21 
 
 		 447 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  40.48 
 
 		 560 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  42.9 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  41.88 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  41.56 
 
 		 447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  41.56 
 
 		 447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  41.56 
 
 		 447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  41.23 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>