More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2432 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  37.9 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  37.3 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  34.15 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  34.19 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  31.39 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  36.8 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  34.11 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  30.65 
 
 		 742 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  30.08 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  29.57 
 
 		 368 aa  61.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  34.4 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  34.88 
 
 		 531 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 202 aa  60.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  30.16 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  31.45 
 
 		 797 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 		 351 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  29.92 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  29.92 
 
 		 243 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  30.95 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.2 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  33.58 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 		 1133 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 		 1130 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2523  hypothetical protein  29.84 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  31.3 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  28.81 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  32.81 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  34.17 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2376  hypothetical protein  29.84 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  27.83 
 
 		 931 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.8 
 
 		 724 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0891  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  32.06 
 
 		 822 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  33.06 
 
 		 1296 aa  54.3  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3500  response regulator receiver  30.08 
 
 		 356 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1082  response regulator  27.59 
 
 		 367 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  32 
 
 		 320 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 816 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  25.86 
 
 		 368 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0616  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 		 766 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0116444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2695  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 504 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  27.07 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 508 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  26.19 
 
 		 778 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  30 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0796  response regulator receiver domain-containing protein  27.19 
 
 		 328 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.952711  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  28.91 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0980  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1171 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03101  Histidine kinase D5 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ27]  26.61 
 
 		 1879 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.756189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  26.27 
 
 		 850 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1042 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2635  response regulator receiver domain-containing protein  25.44 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0563539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 		 1526 aa  52  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 531 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0703  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 218 aa  52  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0904  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.5 
 
 		 479 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  25.86 
 
 		 368 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1269  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.019586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2176  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 1007 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  29.57 
 
 		 1871 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  29.82 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2377  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0925  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.79 
 
 		 484 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.815173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>