More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2176 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2176  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1007 aa  2029    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 1287 aa  279  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1229 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 1195 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.07 
 
 		 1560 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  32.31 
 
 		 1439 aa  260  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 		 963 aa  258  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  33.28 
 
 		 1060 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 1433 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 1452 aa  242  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  36 
 
 		 735 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1199 aa  239  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1499 aa  237  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 		 944 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  33.06 
 
 		 671 aa  232  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  36.04 
 
 		 676 aa  231  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3459  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.39 
 
 		 1055 aa  230  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 846 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.68 
 
 		 763 aa  229  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 1162 aa  229  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 907 aa  228  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  29.71 
 
 		 782 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  30.19 
 
 		 736 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  35.11 
 
 		 691 aa  225  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  33.94 
 
 		 559 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1765 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1692 aa  221  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 909 aa  220  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  34.05 
 
 		 810 aa  219  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 951 aa  219  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  33.9 
 
 		 764 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1350 aa  219  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 1302 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  30.58 
 
 		 793 aa  217  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 		 1157 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  33.89 
 
 		 1023 aa  217  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 572 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1101 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  30.02 
 
 		 1392 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 650 aa  215  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.24 
 
 		 927 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1350 aa  214  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  36.03 
 
 		 1125 aa  214  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1274 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  31.91 
 
 		 772 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 		 936 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  30.83 
 
 		 925 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  34.26 
 
 		 977 aa  213  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 822 aa  212  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  33.7 
 
 		 641 aa  211  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 1303 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  27.93 
 
 		 732 aa  209  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1125 aa  208  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 631 aa  208  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1406 aa  207  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1625 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 865 aa  207  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 827 aa  206  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 965 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 		 1029 aa  206  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.54 
 
 		 582 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.35 
 
 		 620 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  32.14 
 
 		 762 aa  205  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 724 aa  205  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 969 aa  205  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 817 aa  205  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1820 aa  204  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  32.38 
 
 		 794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 844 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 844 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1159 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1075 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  34.23 
 
 		 795 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 1204 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.62 
 
 		 2109 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 690 aa  201  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1478 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  30.89 
 
 		 2051 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  31.51 
 
 		 544 aa  201  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03837  Signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 623 aa  201  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  29.8 
 
 		 2312 aa  200  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  30.91 
 
 		 729 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 802 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  31.56 
 
 		 553 aa  200  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 995 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 		 764 aa  200  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.53 
 
 		 2213 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 1068 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  29.04 
 
 		 578 aa  199  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 674 aa  199  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 788 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 869 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1070 aa  197  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 756 aa  197  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1027 aa  197  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  30.35 
 
 		 823 aa  197  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  26.78 
 
 		 755 aa  197  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 737 aa  197  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 1059 aa  197  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>