202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1776 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  508  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  58.65 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  56.9 
 
 		 238 aa  291  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  55 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  55 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  54.17 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  54.81 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  50.83 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  45.49 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  42.92 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  41.74 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  42.49 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  43.64 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  42.08 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  39.42 
 
 		 270 aa  188  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  42.48 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  39.42 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  35.66 
 
 		 242 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  34.44 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  33.33 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  32.46 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  31.62 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  32.27 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  32.02 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  32.02 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  36.67 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  33.19 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30.9 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  29.92 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  30.22 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.25 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27.46 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.77 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  26.67 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  26.6 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  26.83 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  27.93 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  24.15 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.8 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  25.85 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  34.96 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.32 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.69 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  28.21 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  26.19 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.27 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.51 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  26.27 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  33.1 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.8 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.12 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  25.53 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  24.88 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  31.41 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  26.16 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  27.64 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  25 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  27.16 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  25.83 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  25.24 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  26.47 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  25.42 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  26.02 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  27.87 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  27.08 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  25.52 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  25.42 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  26.29 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  26.23 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  26.53 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  25 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  24.52 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  26.61 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  25.21 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  23.21 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  26.09 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  27.55 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  30.69 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  26.64 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  27.6 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  26.18 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  25.49 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  31.09 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  23.63 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  26.84 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  25.22 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  26.15 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  24.69 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  28.02 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>