270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11593 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  46.03 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 
213 aa  118  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 
213 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
204 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 
217 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 
205 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.27 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  24.74 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  23.35 
 
 
377 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  26.56 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.87 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  24.16 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  23.98 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  28.65 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  24.62 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  28.07 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  23.53 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  27.44 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  22.71 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  25.47 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  22.29 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  41.07 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 
232 aa  54.7  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  23.93 
 
 
187 aa  54.7  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  27.12 
 
 
250 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  22.35 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  24.7 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  21.76 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  26.83 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  24.4 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.38 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  24.4 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  22.22 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  25.86 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 
329 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  28.4 
 
 
359 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.45 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.91 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
342 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 
316 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  29.01 
 
 
316 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  25.73 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.73 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  25.73 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  23.93 
 
 
185 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  25.73 
 
 
187 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
214 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.65 
 
 
227 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  25.88 
 
 
192 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 
234 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  38.46 
 
 
176 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 
240 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  18.37 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  37.5 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  37.74 
 
 
359 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  32.98 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  31.11 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.85 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  26.36 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  23.04 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 
247 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.85 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.85 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  26.99 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  22.95 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  42 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  24.08 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  24.85 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  41.51 
 
 
173 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 
234 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>