127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0011 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  87.91 
 
 		 422 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  67.29 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  58.03 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  57.79 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  57.79 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  57.79 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  57.55 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  57.55 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  57.07 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  52.4 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  51.2 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  50.49 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  50.48 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  49.76 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  49.28 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  53.35 
 
 		 424 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  51.92 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  53.21 
 
 		 438 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  52.28 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  51.21 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  51.64 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  51.64 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  51.64 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  50.24 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  44.95 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  48.29 
 
 		 410 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  43.97 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  44.26 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  32.35 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.45 
 
 		 444 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  31.92 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.65 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.93 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  28.47 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.49 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  28.94 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  29.4 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.5 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  23.82 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  22.93 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  27.33 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.18 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.11 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  23.04 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  31.38 
 
 		 562 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.73 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  30.43 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.38 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  26.5 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.61 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  25.53 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  25.53 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  25.53 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  26.53 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  28.18 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25.23 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.89 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  21.91 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  21.67 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31.61 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  22.61 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.55 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.1 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  25.78 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.81 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  28.81 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.27 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  21.76 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  20.67 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.51 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  20.75 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  22.79 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.03 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  21.83 
 
 		 459 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  39.47 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  42.68 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.53 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  22.88 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.04 
 
 		 474 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.88 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  22.46 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  26.86 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  26.68 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  21.9 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  35.11 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  37.23 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  35.11 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.19 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  27.88 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  30.23 
 
 		 647 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.94 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  38.33 
 
 		 552 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  36.84 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  34.62 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  36.25 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  47.46 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  28.06 
 
 		 407 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  31.91 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>