163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5124 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  77.53 
 
 
178 aa  302  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  63.28 
 
 
178 aa  256  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.44 
 
 
184 aa  216  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.28 
 
 
179 aa  197  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.07 
 
 
182 aa  168  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  43.67 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.27 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.63 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.9 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  36.21 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.06 
 
 
172 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  35.06 
 
 
172 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  39.38 
 
 
177 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.71 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  37.29 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  39.24 
 
 
177 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.25 
 
 
184 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.43 
 
 
182 aa  104  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 
191 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.74 
 
 
179 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.39 
 
 
182 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  31.61 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.25 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.54 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  36 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
177 aa  97.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  32.77 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.62 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 
188 aa  94.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  33.54 
 
 
179 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.54 
 
 
179 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  33.54 
 
 
179 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  28.16 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.32 
 
 
227 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.07 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  26.67 
 
 
181 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.09 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  29.89 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.66 
 
 
183 aa  92  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.95 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.18 
 
 
186 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.74 
 
 
181 aa  90.9  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.18 
 
 
186 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  27.65 
 
 
208 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 
213 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.72 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.11 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  30.64 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.85 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  31.51 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  29.14 
 
 
184 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.52 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  27.81 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.48 
 
 
225 aa  84.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  30.82 
 
 
186 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  34.23 
 
 
183 aa  84  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  27.75 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  25.88 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  25.88 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  28.16 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  29.38 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  28.16 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  26.01 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  26.74 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.82 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  26.67 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  28.85 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  23.84 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  27.33 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  27.01 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.29 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.15 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  24.55 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  31.33 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.67 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.6 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.05 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  25.15 
 
 
198 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  31.96 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.58 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 
210 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.87 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.39 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 
183 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  25.26 
 
 
187 aa  51.6  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  23.08 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.32 
 
 
217 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  32.18 
 
 
190 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.31 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.06 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  29.07 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.46 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  30.77 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>