More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7301 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
1247 aa  2558    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  28.66 
 
 
1164 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.36 
 
 
1217 aa  100  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.55 
 
 
1364 aa  97.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 
1481 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.21 
 
 
1009 aa  94.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 
1399 aa  93.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.9 
 
 
1510 aa  92.8  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.8 
 
 
1553 aa  92.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.84 
 
 
1623 aa  92  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.57 
 
 
1363 aa  91.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 
968 aa  90.1  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.34 
 
 
2741 aa  89.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 
1163 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.54 
 
 
717 aa  89  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 
696 aa  89  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.52 
 
 
344 aa  88.6  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.47 
 
 
1193 aa  88.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 
344 aa  87.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.78 
 
 
1557 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 
1208 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.16 
 
 
1599 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.24 
 
 
1831 aa  85.9  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.84 
 
 
1789 aa  85.5  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.6 
 
 
1661 aa  84.7  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.54 
 
 
1599 aa  84.7  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.86 
 
 
1607 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.23 
 
 
1686 aa  84.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.52 
 
 
1652 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.34 
 
 
1196 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.21 
 
 
2741 aa  84  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.11 
 
 
1262 aa  83.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  33.72 
 
 
1041 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.37 
 
 
1039 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1161 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.73 
 
 
737 aa  82  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1161 aa  81.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.56 
 
 
1211 aa  81.6  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.9 
 
 
1221 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.24 
 
 
1807 aa  81.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 
1878 aa  80.1  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.42 
 
 
1609 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.45 
 
 
1229 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 
947 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  21.85 
 
 
1007 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.68 
 
 
1188 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 
1240 aa  79.7  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.45 
 
 
1858 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.68 
 
 
1868 aa  79  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
854 aa  79  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28.09 
 
 
1656 aa  79  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.62 
 
 
1373 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.92 
 
 
919 aa  78.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.84 
 
 
1547 aa  78.2  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.45 
 
 
1188 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.51 
 
 
1357 aa  77.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
916 aa  77.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.16 
 
 
1711 aa  77.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
1443 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 
1176 aa  75.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 
577 aa  75.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.65 
 
 
1598 aa  75.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.27 
 
 
1901 aa  75.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.42 
 
 
1523 aa  75.5  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.14 
 
 
742 aa  75.5  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.99 
 
 
1367 aa  74.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.77 
 
 
1760 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.73 
 
 
1236 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.3 
 
 
657 aa  74.3  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
729 aa  74.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.24 
 
 
1856 aa  73.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.47 
 
 
1552 aa  73.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  21.98 
 
 
1714 aa  73.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.51 
 
 
1190 aa  73.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.56 
 
 
1348 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
1215 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.62 
 
 
1247 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 
994 aa  72.4  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.15 
 
 
1684 aa  72.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.27 
 
 
532 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.87 
 
 
1454 aa  72  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.73 
 
 
1398 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.46 
 
 
1474 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  23.72 
 
 
608 aa  70.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  21.9 
 
 
495 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.78 
 
 
692 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  22.78 
 
 
1051 aa  69.7  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.37 
 
 
1209 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.66 
 
 
1583 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
1276 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.71 
 
 
1411 aa  68.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  22.37 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  21.97 
 
 
1280 aa  68.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.47 
 
 
677 aa  68.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.5 
 
 
930 aa  68.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 
1177 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.95 
 
 
664 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  32.61 
 
 
589 aa  68.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
846 aa  67.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.07 
 
 
1617 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>