125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0308 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0308  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 191 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  85 
 
 		 182 aa  287  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3503  2',5' RNA ligase  87.78 
 
 		 192 aa  270  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0335  2'-5' RNA ligase  85.56 
 
 		 182 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2702  2',5' RNA ligase  83.07 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0405  2'-5' RNA ligase  83.07 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0384  2'-5' RNA ligase  82.11 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  56.59 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  56.04 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  56.04 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  56.04 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  56.04 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  56.04 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  56.04 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  56.04 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2786  2'-5' RNA ligase  44.89 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  35.06 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  34.64 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  36.09 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  35.8 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.53 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  33.89 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  31.84 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  34.25 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  27.67 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  31.36 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  32.42 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  30.36 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  32.61 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  22.46 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  32.87 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  31.44 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  30.39 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  19.55 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  33.91 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  35.19 
 
 		 154 aa  52.4  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  32.2 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  30.6 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  38.93 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.57 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  35.14 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  32.6 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  35.81 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  35.14 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  25.17 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1760  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.907021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  32.74 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  36.15 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.48 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2064  2'-5' RNA ligase  32.4 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  34.06 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  34.06 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  27.27 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1635  2'-5' RNA ligase  37.06 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  34.01 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  33.77 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  30.14 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  31.35 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  27.01 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  26.06 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  27.33 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  31.9 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  28.21 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  28.79 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  30.65 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  28.21 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  23.26 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  28.21 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  24 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  21.54 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  36.04 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  18.82 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  35.62 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1946  2',5' RNA ligase  27.11 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  22.02 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  22.31 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  35.96 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  31.79 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  30.49 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.08 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  25.98 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>