More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 551 aa  1120    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  47.74 
 
 		 567 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  41.18 
 
 		 562 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 531 aa  318  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  33.7 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  31.43 
 
 		 547 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  33.6 
 
 		 627 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  35 
 
 		 567 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 		 579 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  30.96 
 
 		 553 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  31.16 
 
 		 548 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 557 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  30.6 
 
 		 548 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 		 554 aa  230  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  30.55 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 		 569 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.55 
 
 		 545 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 		 540 aa  213  9e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30 
 
 		 552 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.37 
 
 		 564 aa  210  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 		 560 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 568 aa  206  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  28.02 
 
 		 560 aa  203  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 		 568 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.23 
 
 		 556 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  27.97 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 557 aa  186  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 557 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 609 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 		 580 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.21 
 
 		 563 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  29.36 
 
 		 572 aa  178  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 576 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 636 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.38 
 
 		 563 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 560 aa  160  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 604 aa  150  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 604 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25 
 
 		 572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.41 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 510 aa  124  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.97 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.37 
 
 		 645 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 		 534 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.16 
 
 		 524 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.64 
 
 		 588 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.44 
 
 		 542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 608 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.32 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 510 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 530 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 576 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.2 
 
 		 589 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 579 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.72 
 
 		 543 aa  107  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 517 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 540 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.01 
 
 		 550 aa  106  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 555 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 543 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  22.89 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.22 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  25.63 
 
 		 577 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 606 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.53 
 
 		 538 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.74 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 		 516 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 622 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.43 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 		 533 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.32 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 539 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 565 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  29.1 
 
 		 503 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.16 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 615 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.28 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>