More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 550 aa  1104    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  70.27 
 
 		 550 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  48.63 
 
 		 543 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  49.71 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  47.72 
 
 		 554 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  46.82 
 
 		 541 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  48.65 
 
 		 545 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  48.84 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  49.61 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  48.44 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  45.33 
 
 		 562 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  35.02 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.01 
 
 		 562 aa  237  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.67 
 
 		 542 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 		 535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  31.83 
 
 		 550 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  31.65 
 
 		 551 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 		 554 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  32.95 
 
 		 532 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 557 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  31.71 
 
 		 558 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 587 aa  203  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 		 537 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 		 537 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  30.2 
 
 		 542 aa  193  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.12 
 
 		 539 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 546 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 		 551 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 511 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.98 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 560 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  28.57 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  26.65 
 
 		 553 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 546 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 546 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  28.9 
 
 		 546 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 601 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 		 548 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 564 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 527 aa  120  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.35 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.34 
 
 		 551 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 565 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  21.89 
 
 		 521 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.38 
 
 		 562 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  21.89 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.89 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  21.89 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.63 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 562 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 501 aa  106  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.61 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1024  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 		 557 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 529 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.96 
 
 		 546 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 595 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.36 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 575 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.58 
 
 		 526 aa  100  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 508 aa  100  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  26.59 
 
 		 558 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.68 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.68 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.58 
 
 		 575 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  24.72 
 
 		 515 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.92 
 
 		 524 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26 
 
 		 540 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 517 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 		 529 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 607 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.62 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 532 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.79 
 
 		 575 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.42 
 
 		 524 aa  97.8  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 544 aa  98.2  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 493 aa  97.8  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 538 aa  97.4  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.39 
 
 		 524 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>