More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0939 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 532 aa  1066    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  55.26 
 
 		 558 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  50.2 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  50.28 
 
 		 562 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  42.29 
 
 		 542 aa  336  7e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 		 557 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 		 555 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  35.49 
 
 		 541 aa  277  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  36.27 
 
 		 542 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 		 546 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  37.21 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  35.26 
 
 		 542 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  33.46 
 
 		 537 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  38.03 
 
 		 554 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  32.41 
 
 		 537 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 		 543 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.01 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  33.88 
 
 		 554 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.28 
 
 		 539 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 556 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  32.2 
 
 		 551 aa  243  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 511 aa  243  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  34.22 
 
 		 547 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  34.77 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  35.19 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 557 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 		 535 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  33.27 
 
 		 546 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  33.77 
 
 		 547 aa  227  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  31.78 
 
 		 554 aa  227  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 546 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 546 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  33.91 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  31.97 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  32.76 
 
 		 560 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 		 541 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  32.82 
 
 		 562 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  30.91 
 
 		 550 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.94 
 
 		 550 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  32.3 
 
 		 553 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.73 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 550 aa  188  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 		 544 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 		 551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.94 
 
 		 516 aa  150  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  27.47 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 517 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.44 
 
 		 534 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.79 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.44 
 
 		 537 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 536 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 		 508 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.53 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 544 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.26 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.64 
 
 		 538 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.67 
 
 		 524 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 545 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.31 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 519 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.14 
 
 		 534 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.12 
 
 		 551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.46 
 
 		 546 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  25.59 
 
 		 538 aa  134  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 550 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 601 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.56 
 
 		 532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 		 536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.56 
 
 		 532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.68 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.17 
 
 		 541 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 		 529 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.69 
 
 		 526 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.69 
 
 		 526 aa  130  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.33 
 
 		 538 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.15 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0365  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.5 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.53 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  24.7 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.84 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 509 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.87 
 
 		 588 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.55 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3398  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.22 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>