More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1057 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  61.51 
 
 		 562 aa  671    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 557 aa  1125    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  70.66 
 
 		 554 aa  767    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  74.85 
 
 		 545 aa  811    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  73.18 
 
 		 547 aa  783    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  73.31 
 
 		 545 aa  798    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  75.48 
 
 		 547 aa  819    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  70.41 
 
 		 541 aa  762    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  69.59 
 
 		 543 aa  764    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  48.44 
 
 		 550 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  47.48 
 
 		 550 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  34.24 
 
 		 550 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  35.59 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  34.23 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  34.28 
 
 		 535 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  34.12 
 
 		 547 aa  253  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.7 
 
 		 542 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.5 
 
 		 562 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  35.75 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  34.23 
 
 		 532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  33.45 
 
 		 558 aa  233  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 587 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  31.99 
 
 		 554 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 		 556 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 		 542 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  31.06 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 543 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.11 
 
 		 539 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 555 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 546 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 537 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  29.83 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  28.36 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  29.28 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 		 544 aa  169  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 551 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  28.13 
 
 		 553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.54 
 
 		 550 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 		 534 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 601 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 551 aa  147  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.15 
 
 		 535 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 564 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.86 
 
 		 524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.7 
 
 		 521 aa  134  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  25.79 
 
 		 530 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.33 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.33 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.33 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  30.99 
 
 		 518 aa  130  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27 
 
 		 538 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 524 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.38 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  28.38 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  28.38 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  28.38 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.08 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  28.57 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.12 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.57 
 
 		 493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.31 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.02 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 512 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.24 
 
 		 575 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  29.4 
 
 		 514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.71 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  29.75 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 519 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.75 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.37 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  29.44 
 
 		 513 aa  114  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  26.55 
 
 		 575 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 492 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.99 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.03 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>