More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0682 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  320  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  94.81 
 
 
156 aa  268  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  94.81 
 
 
156 aa  268  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  94.81 
 
 
156 aa  268  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  92.21 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 
151 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
146 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  42.28 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 
156 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  30.13 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  24.19 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  29.47 
 
 
287 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
142 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
142 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
188 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  26.43 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.79 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.79 
 
 
144 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 
154 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 
144 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
303 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  31.33 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  40.98 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.33 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
194 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.29 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  25.53 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  25.53 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  31.82 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.67 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>