More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2753 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  95.09 
 
 		 510 aa  974    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  100 
 
 		 510 aa  1025    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  94.7 
 
 		 530 aa  969    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  51.86 
 
 		 516 aa  478  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  49.49 
 
 		 522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  50.2 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  48.98 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  48.37 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  48.6 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  33.91 
 
 		 519 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 		 528 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  33.7 
 
 		 521 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  33.27 
 
 		 514 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  33.14 
 
 		 522 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  30.71 
 
 		 527 aa  199  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  34.42 
 
 		 514 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 494 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  27.13 
 
 		 526 aa  150  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.76 
 
 		 542 aa  143  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  26.82 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  24.67 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 505 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.17 
 
 		 532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  26.22 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.9 
 
 		 764 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25.43 
 
 		 570 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  26.88 
 
 		 571 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 510 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  25.77 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 549 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.58 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  24.07 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 531 aa  110  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.82 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.9 
 
 		 514 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.4 
 
 		 553 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  28.49 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  24.29 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  27.16 
 
 		 576 aa  103  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  25.85 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  25.55 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  24.93 
 
 		 547 aa  97.4  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  22.92 
 
 		 495 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 505 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 497 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.44 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  23.45 
 
 		 547 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  25.26 
 
 		 539 aa  89.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 487 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.91 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  24.08 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  23.98 
 
 		 516 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  24.06 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  25.27 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.7 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  27.3 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.92 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  25.74 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  24.52 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.62 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  26.42 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  23.17 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  25.23 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.4 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  23.49 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24.38 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>