More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0642 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  39.76 
 
 		 1155 aa  832    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  35.9 
 
 		 1169 aa  668    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1176 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  36.03 
 
 		 1176 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1178 aa  653    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1176 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  36.11 
 
 		 1183 aa  707    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  30.84 
 
 		 1157 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  37.26 
 
 		 1176 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  35.86 
 
 		 1165 aa  690    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  35.52 
 
 		 1177 aa  697    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  32.06 
 
 		 1161 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  30.8 
 
 		 1157 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  32.6 
 
 		 1158 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  36.01 
 
 		 1168 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  36.03 
 
 		 1176 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  31.87 
 
 		 1159 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  36.01 
 
 		 1168 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  33.55 
 
 		 1183 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  37.68 
 
 		 1178 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  32.9 
 
 		 1112 aa  640    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0642  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1125 aa  2211    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0432582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  30.85 
 
 		 1165 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.65 
 
 		 1179 aa  667    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1176 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.79 
 
 		 1176 aa  652    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  37.23 
 
 		 1179 aa  692    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  36.28 
 
 		 1176 aa  656    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  35.33 
 
 		 1174 aa  656    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  37.13 
 
 		 1162 aa  694    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  37.5 
 
 		 1162 aa  693    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  36.37 
 
 		 1176 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  38.36 
 
 		 1170 aa  684    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  35 
 
 		 1073 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  34.55 
 
 		 1196 aa  636    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1162 aa  657    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  37.08 
 
 		 1177 aa  679    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  35.93 
 
 		 1165 aa  675    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  32.39 
 
 		 1197 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  32.09 
 
 		 1169 aa  670    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  34.24 
 
 		 1177 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1176 aa  654    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  34.08 
 
 		 1197 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  32.95 
 
 		 1157 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  32.95 
 
 		 1157 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  34.14 
 
 		 1182 aa  632  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  32.84 
 
 		 1123 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  30.18 
 
 		 1176 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  33.77 
 
 		 1189 aa  623  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1126 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  31.75 
 
 		 1157 aa  618  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  38.84 
 
 		 1170 aa  618  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  31.73 
 
 		 1174 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  31.87 
 
 		 1153 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  33.21 
 
 		 1160 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  31.96 
 
 		 1164 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4332  transcription-repair coupling factor  30.03 
 
 		 1241 aa  612  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0186143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  32.32 
 
 		 1155 aa  611  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  32.13 
 
 		 1149 aa  612  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4487  transcription-repair coupling factor  29.16 
 
 		 1233 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  31.05 
 
 		 1158 aa  608  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  31.67 
 
 		 1155 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4468  transcription-repair coupling factor  29.25 
 
 		 1241 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  33.83 
 
 		 1157 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  33.9 
 
 		 1157 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1859  transcription-repair coupling factor  31.69 
 
 		 1156 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0201793  hitchhiker  0.000194707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  35.7 
 
 		 1150 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1327  transcription-repair coupling factor  32.52 
 
 		 1156 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241535  hitchhiker  0.000253034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  31.86 
 
 		 1207 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2088  transcription-repair coupling factor  32.09 
 
 		 1217 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  33.4 
 
 		 1157 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  32.86 
 
 		 1162 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1932  transcription-repair coupling factor  31.87 
 
 		 1185 aa  606  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  32.66 
 
 		 1198 aa  604  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  31.18 
 
 		 1160 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  31.96 
 
 		 1157 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1491  transcription-repair coupling factor  31.91 
 
 		 1157 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1968  transcription-repair coupling factor  32.39 
 
 		 1156 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.095546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2513  transcription-repair coupling factor  31.91 
 
 		 1189 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2402  transcription-repair coupling factor  32 
 
 		 1189 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1904  transcription-repair coupling factor  32.55 
 
 		 1143 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288854 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3318  transcription-repair coupling factor  31.91 
 
 		 1189 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.101121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2359  transcription-repair coupling factor  31.91 
 
 		 1189 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.741078  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1988  transcription-repair coupling factor  31.91 
 
 		 1157 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232338  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1260  transcription-repair coupling factor  31.91 
 
 		 1189 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4478  transcription-repair coupling factor  28.93 
 
 		 1229 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6135  transcription-repair coupling factor  32.3 
 
 		 1156 aa  602  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  33.37 
 
 		 1143 aa  599  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  31.19 
 
 		 1160 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  45.57 
 
 		 1179 aa  600  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1944  transcription-repair coupling factor  32.3 
 
 		 1156 aa  602  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1617  transcription-repair coupling factor  29.7 
 
 		 1147 aa  598  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.89425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  31.85 
 
 		 1147 aa  598  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  31.34 
 
 		 1149 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  33.09 
 
 		 1115 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1575  transcription-repair coupling factor  32.46 
 
 		 1143 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221185  normal  0.0233451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  36.55 
 
 		 1059 aa  599  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  30.97 
 
 		 1165 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  31.11 
 
 		 1160 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  31.19 
 
 		 1160 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>