More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1189 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  62.9 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  52.44 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  54.3 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  53.54 
 
 		 227 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  53.54 
 
 		 227 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  53.54 
 
 		 227 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  53.54 
 
 		 227 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  53.85 
 
 		 227 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 227 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  52.65 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.65 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 227 aa  224  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  50.23 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 231 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  50 
 
 		 237 aa  214  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  214  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  48.67 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  49.33 
 
 		 227 aa  211  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2129  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  44.64 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  48.42 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6539  response regulator receiver domain-containing protein  77.27 
 
 		 159 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1865  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3245  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.124036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  44.84 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  45.7 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3091  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.63 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  46.4 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.08 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  40.09 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.52 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0620  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.48 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  39.46 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  37.1 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  39.46 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  42.99 
 
 		 272 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  37 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  42.53 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1929  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.541945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.41 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2809  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  42.48 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  36.65 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.44 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.08 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  158  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 635 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.08 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  42.04 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.6 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  35.43 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>