More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1929 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1929  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.541945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  45.74 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  44.39 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4328  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  40.54 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4007  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  41.63 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  41.74 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  41.1 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  42.53 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  42.21 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2431  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  40.83 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.09 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  41.36 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  42.08 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.09 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.09 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  41.05 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.29 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1414  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  37.27 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  36.65 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  40.27 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.27 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2759  two-component response regulator  44.55 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32580  two-component response regulator  44.55 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3245  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.124036  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 245 aa  141  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3091  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.01 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0691  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  39.82 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  39.82 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.27 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  37.13 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>